Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms