Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CICQ96RK0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms