Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms