Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGLYRP3Q96LB9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGLYRP3Q96LB9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms