Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG4CQ96DT6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms