Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG2BQ96BY7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms