Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms