Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP28Q4G0W2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms