Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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