Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms