Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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