Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HDM1Q15032 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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