Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NBR1Q14596 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms