Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms