Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCINQ13939 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCINQ13939 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCINQ13939 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCINQ13939 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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