Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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