Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FHL3Q13643 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms