Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCOF1Q13428 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCOF1Q13428 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
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