Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms