Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RELBQ01201 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RELBQ01201 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RELBQ01201 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RELBQ01201 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELBQ01201 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms