Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms