Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms