Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VBP1P61758 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VBP1P61758 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VBP1P61758 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VBP1P61758 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms