Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms