Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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PGGT1BP53609 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PGGT1BP53609 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PGGT1BP53609 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PGGT1BP53609 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PGGT1BP53609 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PGGT1BP53609 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PGGT1BP53609 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGGT1BP53609 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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