Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2A2P52657 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A2P52657 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms