Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ME1P48163 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ME1P48163 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ME1P48163 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ME1P48163 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ME1P48163 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ME1P48163 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ME1P48163 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ME1P48163 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms