Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms