Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B4P23634 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms