Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF1AP20823 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF1AP20823 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms