Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPCAMP16422 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPCAMP16422 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EPCAMP16422 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPCAMP16422 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPCAMP16422 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPCAMP16422 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPCAMP16422 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPCAMP16422 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EPCAMP16422 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EPCAMP16422 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EPCAMP16422 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EPCAMP16422 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms