Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRF1P14222 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRF1P14222 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRF1P14222 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms