Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C8orf88P0DMB2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms