Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD74P04233 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD74P04233 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD74P04233 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms