Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAPBO95292 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms