Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM6AO15550 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM6AO15550 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms