Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCER2I3L3R5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCER2I3L3R5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms