Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3CA6NKF2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms