Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SERINC4A6NH21 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SERINC4A6NH21 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms