Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms