Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A3GALT2U3KPV4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms