Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN7Q9Y6W3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms