Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HCN4Q9Y3Q4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HCN4Q9Y3Q4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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HCN4Q9Y3Q4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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HCN4Q9Y3Q4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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HCN4Q9Y3Q4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HCN4Q9Y3Q4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HCN4Q9Y3Q4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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