Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms