Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK3Q9UBP4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms