Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNMT3BQ9UBC3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNMT3BQ9UBC3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNMT3BQ9UBC3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DNMT3BQ9UBC3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DNMT3BQ9UBC3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNMT3BQ9UBC3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms