Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms