Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAPAQ9P0L0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms