Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms