Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLE1Q9NVX2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms